RNA BASER Sequence Assembler 3.1

Licentie: Gratis ‎Bestandsgrootte: 1.34 MB
‎Gebruikersbeoordeling: 3.2/5 - ‎15 ‎Stemmen

www.DnaBaser.com Eenvoudig te gebruiken aligner software voor RNA sequentie contig assemblage, aaneengesloten bewerken, en mutatie detectie voor Windows. Het is een moleculaire biologie software die kan bekijken en samenstellen sequenties in aaneengesloten. Kenmerken: eindclip, exportreeksen, samenstellingen, codedetectie. Beschrijving: RNA Baser is een betaalbaar alternatief voor de assemblage van RNA sequenties en het genereren van aaneengesloten. Ondersteunde bestandsindelingen zijn abi, scf en seq (of FASTA). Chromatogrammen van de geassembleerde sequenties worden weergegeven in een gesynchroniseerde indeling met de gegenereerde aaneengesloten. Dubbelzinnige grondslagen in de aaneengesloten worden gemarkeerd en correcties worden voorgesteld door DnaBaser op basis van kwaliteitswaarden van de traceerbestanden. Minimale invoer van de gebruiker vereist. Het bewerken van dubbelzinnige basissen, inclusief invoeging en verwijdering, is mogelijk. De instellingen van de montagemotor kunnen door de gebruiker worden aangepast. De gebruiker kan het uiterlijk van chromatogrammen, nucleotiden, achtergrond personaliseren. De kwaliteitswaarden van de traceerbestanden worden boven chromatogrammen weergegeven, zodat de gebruiker gemakkelijk kan beslissen over de correcties in de uiteindelijke aaneengesloten. Originele chromatogrambestanden worden automatisch bijgesneden op basis van kwaliteitswaarden. De aaneengesloten wordt automatisch opgeslagen in FASTA-indeling, in dezelfde map met de oorspronkelijke traceerbestanden. Door gebruik te maken van een opgebouwde database van primer- en vectorsequenties, die door de gebruiker kunnen worden bewerkt/geüpgraded, kan DnaBaser worden ingesteld om de vectorsequentie automatisch uit de uiteindelijke aaneengesloten te trimmen. Beschrijving: Eenvoudig te gebruiken aligner software voor RNA sequencing tool, aaneengesloten bewerken, en mutatie detectie voor Windows. Het is een moleculaire biologie software die kan bekijken en samenstellen sequenties in aaneengesloten. Kenmerken: eindclip, exportreeksen, samenstellingen, codedetectie. Het is een prijs alternatief voor RNA contig assemblage. Download freeware-tools voor bestandsconversie. trim vector sequentie vrij programma uitlijning basis converteren consensus sequencing trace mac os x windows mutatie primer, real-time pcr kwaliteit.

versiegeschiedenis

  • Versie 3.1 geplaatst op 2012-03-18
    Volgorde assemblage. Duizenden aaneengesloten kunnen tegelijk worden geassembleerd.
  • Versie 2.77 geplaatst op 2009-01-05
    Batchassemblage. Duizenden aaneengesloten kunnen tegelijk worden geassembleerd.

Programmadetails